прогулка по хромосоме

chromosome walking

[греч. chroma — цвет, окраска и soma — тело]

метод анализа протяженных нуклеотидных последовательностей вокруг секвенированных участков генома с использованием "блуждающих" праймеров (см. праймер-опосредованная прогулка), который заключается в последовательном отборе клонов, содержащих частично перекрывающиеся фрагменты ДНК из определенного района генома. На первом этапе проводят скрининг библиотеки генов с помощью маркерной ДНК, сцепленной с определенным геном. После нахождения положительных клонов последние сами служат зондами для изоляции других клонов, содержащих перекрывающиеся нуклеотидные последовательности ДНК; т. обр., каждый раз отобранный фрагмент используется в качестве скринирующего ДНКзонда для последующего поиска. В результате получают набор клонированных фрагментов ДНК, полностью перекрывающих область поиска гена. Группа подобных клонов носит название "контигов" (см. контиг). С помощью физического картирования инсерционных ДНК в разных клонах удается точно установить степень перекрывания между соседними фрагментами и соответственно упорядочить положение клонов в контигах. В результате "П."п.х. с помощью перекрывающихся нуклеотидных последовательностей анализируются неизвестные протяженные участки генома, прилегающие друг к другу. Одним из вариантов метода "П".п.х. является метод "прыжков по хромосоме" (см. прыжки по хромосоме). Метод "П."п.х. был предложен В. Бендером, П. Спирером и Д. Хогнессом в 1979 г.